在孵化厂的消毒室进行消毒，每立方米空间用福尔马林42毫升、高锰酸钾21克，在温度20～24℃以上，相对湿度75～80%以上的条件下，熏蒸20分钟，效果较好，可杀死蛋壳上95～98.5%的病原体。如在孵化器里消毒，则需在入孵后马上进行，一般采用每立方米空间福尔马林28毫升、高锰酸钾14克，熏蒸20分钟。在国内，多采用入孵时消毒，每立方米空间用福尔马林14毫升、高锰酸钾7克，熏蒸半小时至1小时。在实际操作中还可以在蛋盘架上罩以塑料薄膜，进行消毒。这样缩小了体积，可节约用药量。用甲醛熏蒸消毒法时，应注意下列几点：
 

1.种蛋在孵化器里熏蒸消毒时，应避开1～4天胚龄的胚蛋。因为上述药物对1～4天胚龄的胚胎有不利影响。 
 

3.种蛋从蛋库取出或从鹅舍送至孵化厂消毒室后，如蛋壳上凝有水珠，熏蒸时对胚胎不利，应当尽量避免。解决方法是提高温度，等到水珠蒸发后，再进行消毒。（二）新洁尔灭消毒法